Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

ODEion- a software module… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

ODEion- a software module for structural identification of ordinary differential equations

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Peter Gennemark
Dag Wedelin
Publicerad i Journal of Bioinformatics and Computational Biology
Volym 12
Nummer/häfte 1
Sidor Art. no. 1350015
ISSN 0219-7200
Publiceringsår 2014
Publicerad vid Institutionen för matematiska vetenskaper
Sidor Art. no. 1350015
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1142/S021972001350015...
Ämneskategorier Beräkningsmatematik, Datalogi, Bioinformatik (beräkningsbiologi)

Sammanfattning

In the systems biology field, algorithms for structural identification of ordinary differential equations (ODEs) have mainly focused on fixed model spaces like S-systems and/or on methods that require sufficiently good data so that derivatives can be accurately estimated. There is therefore a lack of methods and software that can handle more general models and realistic data. We present ODEion, a software module for structural identification of ODEs. Main characteristic features of the software are: • The model space is defined by arbitrary user-defined functions that can be nonlinear in both variables and parameters, such as for example chemical rate reactions. • ODEion implements computationally efficient algorithms that have been shown to efficiently handle sparse and noisy data. It can run a range of realistic problems that previously required a supercomputer. • ODEion is easy to use and provides SBML output. We describe the mathematical problem, the ODEion system itself, and provide several examples of how the system can be used. Read More: http://www.worldscientific.com/doi/abs/10.1142/S0219720013500157

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?