Biostatistik och experimentdesign, avancerad linjär modellering

Kursen ingår som en valbar kurs i kandidatprogrammet i biologi, men ges även som fristående kurs.

För tillträde till kursen krävs genomgången kurs BIO172, Biostatistik och experimentdesign, enfaktorsanalyser, 7.5 hp

Kursen är en fortsättning på kursen, BIO172, Biostatistik och experimentell design, enfaktoranalyser och fokuserar på avancerade linjära modeller. Övervägande av experimentell design utökas från BIO172. Kursen omfattar övervägande av statistiska interaktioner, modelljämförelse och urval, generaliserade och blandade (hierarkiska) modeller.

Kursen innehåller många empiriska exempel från föreläsarnas eget laboratorie- och fältarbete och innehåller flera statistiska mjukvarupaket (t.ex. R och SAS) och ramverk, inklusive kritik av nollhypotestestning och alternativa tillvägagångssätt för statistiska analyser.

Efter avslutad kurs ska studenten kunna:

Kunskap och förståelse

• Förstå och förklara principerna med vilka avancerade linjära modeller uppskattar koefficienter

• Uppskatta och förklara innebörden av partiella samband mellan prediktorer och svarsvariabler

• Förstå skillnaden mellan och relevansen av slumpmässiga och fixerade effekter

Färdigheter och förmåga

• Bygga avancerade linjära modeller med kategoriska och kontinuerliga prediktorer och interaktioner

• Integrera slumpmässiga effekter i modellkonstruktion som är lämpligt för datastrukturen och den vetenskapliga frågan

• Jämföra och välja bland flera alternativa modeller med sparsamhet och informationsteoretiska tillvägagångssätt

• Förklara och försvara modellbeslut som används för att behandla vetenskapliga frågor

Värderingsförmåga och förhållningssätt

• Kritiskt utvärdera rapporter om vetenskapliga resultat från andra och bedöma vikten av bevis för fenomen som involverar flera variabler

• Uppskatta de etiska och praktiska konsekvenserna av reproducerbarhetskrisen inom biostatistik

Undervisningen sker genom föreläsningar, datorövningar, litteraturuppgifter och seminarier med grupparbete. Datorövningar examineras och litteraturuppgifter diskuteras under seminarier med obligatorisk närvaro.

Undervisningsspråk: engelska och svenska Kursen ges på både svenska och engelska. Observera att viss litteratur och material för övningar endast finns på engelska.

Examinationen sker i två steg. För betyget G (Godkänd) krävs korrekta inlämnade rapporter samt deltagande i seminarier och gruppdiskussioner. För betyget VG (Väl godkänd) krävs, utöver ovanstående krav, att studenten genomför en avslutande skriftlig examination och där uppnår 85% rätta svar.

Möjlighet att komplettera obligatoriska moment kan ges inom ramen för kursen eller vid nästa kurstillfälle.

En student som har underkänts på en tentamen två gånger har rätt att byta examinator, såvida inte tungt vägande skäl kan anföras. Ansökan ska skickas till institutionen och ska vara skriftlig

Betygsskalan omfattar: Väl godkänd (VG), Godkänd (G) och Underkänd (U).

För betyget G (Godkänd) krävs korrekta inlämnade rapporter samt deltagande i seminarier och gruppdiskussioner. För betyget VG (Väl godkänd) krävs, utöver ovanstående krav, att studenten genomför en avslutande skriftlig examination och där uppnår 85% rätta svar.

En skriftlig kursvärdering görs vid kursens slut. En sammanfattning av kursvärderingen, samt belysande av eventuella förändringar, presenteras för både innevarande och nästkommande kurs.