Precisionsmedicin utgör ett paradigmskifte inom den medicinska forskningen och det finns ett behov av att inkludera multiomics för att driva på utvecklingen.
Precisionsmedicin utgör ett paradigmskifte inom den medicinska forskningen genom att introducera mätbara biomarkörer som stöd för kliniska beslut och SciLifeLab har framgångsrikt implementerat precisionsmedicin som en kapacitet. SciLifeLab har, tillsammans med akademi, sjukvård och industri, insett behovet av att införa multiomics i diagnostiken och för att driva utvecklingen av precisionsmedicin. Proteomanalys på systemnivå och sjukdomsassocierade proteinvarianter är en stor oanvänd och informationsrik nivå av kliniska biomarkörer. Förbättrad kromatografi och speciellt masspektrometri (MS) med hög genomströmningsanalys, nya TOF-instrument för känslig jonmobilitet har öppnat helt nya möjligheter att utveckla MS-analys för klinisk forskning. MS-analys erbjuder proteomomfattande analys eller snabb utveckling av analyser för proteinvarianter och post-translationellt modifierade proteiner, inte möjligt att skala upp på någon annan analytisk plattform.
Clinical MS Facility fördelat på tre noder i Lund, Stockholm och Göteborg
Vetenskapsrådet har beviljat medel för nationella MS-infrastrukturinstrument för klinisk MS fördelade på tre noder i Lund, Stockholm och Göteborg. Sex toppmoderna instrument, med snabba vätskekromatografisystem och vätskehanterare för automatiserad provberedning, har nu installerats. Den nya föreslagna SciLifeLab-enheten syftar till att leda den kliniska MS-forskningen och implementeringen genom dedikerad utveckling av standardisering, metoder för prospektiv analys och relaterad kunskap för att definiera kliniskt meningsfulla biomarköravläsningar. Ett nationellt synkroniserat konsortium inom klinisk MS kommer att möjliggöra populationsbaserade undersökningar av massiva kliniska biobankprovsamlingar och tillhandahålla tjänster och verktyg till institutioner och nätverk.
Klinisk MS-analys vid SciLifeLab för att utveckla precisionshälsoforskning
SciLifeLab, med kliniska genomik, vävnadsavbildning, single cells-analys och relaterade datadrivna insatser inom precisionsmedicin utgör en idealisk miljö för en dedikerad klinisk MS-anläggning. MS-analys kan direkt använda provspecifik genomik och transkriptomikdata genom att bilda proteogenomiska sökdatabaser för att tillhandahålla individuell proteominformation, inklusive sekvensvarianter. Dessutom har MS-anläggningen en unik möjlighet att utveckla antikroppsbaserad HTP-analys i populationsskala baserat på exakt MS-data för att utveckla precisionsforskning och tillhandahålla molekylär fenotypnivå för att koppla samman genotyp och histopatologisk avbildningsdata på stora kohorter.
