Bioinformatik för RNA och Proteinanalys
Om utbildningen
I allt större utsträckning studerar biologisk och medicinsk forskning de processer som sker i en cell, ett organ eller en miljö för att få en helhetsbild av alla gener och proteiner som uttrycks. Även sjukvården genererar alltmer patientdata som behöver analyseras och tolkas. Därför behövs personer som kan utföra bioinformatiska analyser och tolka resultaten ur ett biologiskt eller medicinskt perspektiv.
Kursens innehåll
I kursen Bioinformatik för RNA- och proteinanalys lär du dig att använda bioinformatiska metoder, det vill säga metoder för datoranalys och visualisering. Du lär dig också att skriva egen kod för att utföra analyser.
Fokus ligger på att du
- lär dig att hantera stora mängder data från genexpression (transkriptomik) och proteinsekvensanalyser på ett bioinformatiskt sätt.
- förstår transkription- och translationsprocesser hos prokaryota och eukaryota organismer för att kunna tolka den data du studerar.
Du får kunskaper som är viktiga inom molekylärbiologi, biologi och systembiologi, och som kan tillämpas inom de flesta biologiska och medicinska områdena.
Kursen kräver grundläggande kunskaper i Unix/Bash- och Python-programmering från tidigare kurser, till exempel BIO511 – Bioinformatik inom genomik, för att kunna förstå bioinformatika processer kopplade till transkriptom och proteinsekvenser.
Kursen är på engelska.
Behörigheter och urval
Behörighet
För tillträde till kursen krävs godkända kurser om minst 120 hp (eller motsvarande) inom något av följande områden: naturvetenskap (inklusive matematik), medicin och farmaci.
Det rekommenderas att man läst andra kurser i bioinformatik, så som BIO511 eller motsvarande.
Dessutom krävs engelskakunskaper motsvarande nivå Engelska 6/Engelska Kurs B från Svenska Gymnasieskolan, eller certifiering via ett internationellt erkänt prov, till exempel TOEFL eller IELTS eller motsvarande.
Urval
Högskolepoäng, max 165 hp
Efter studierna
Kursen ingår i masterprogrammet i bioinformatik. Du kan även läsa den som fristående kurs.
Så är det att plugga
Undervisningen
Kursen i Bioinformatik för RNA- och proteinanalys består av föreläsningar varvade med övningar där du får använda programmeringsspråken Unix/Bash och Python samt olika program för bioinformatiska analyser. Fokus ligger på att du ska kunna jobba med analyser och metoder under övningarna.
Du presenterar dina resultat muntligt och skriftligt. Dina presentationer samt skriftlig tentamen utgör grunden för examination.
Lokaler
Undervisningen sker i huvudsak i Medicinarelängan och i det nybyggda huset Natrium på Medicinareberget i Göteborg.
