Johannes Borgqvist
Om Johannes Borgqvist
Jag arbetar med mekanistisk matematisk modellering av proteinkinetik inom ramen för åldrande i den knoppande jästen Saccharomyces cerevisiae. Jag jobbar framförallt med system av ordinära och partiella differentialekvationer som beskriver hur koncentrationen av diverse proteiner varierar som funktioner av antingen endast tiden eller som funktioner av både tiden och den rumsliga positionen inom cellen. Givet denna typ av teoretiska ramverk så analyseras egenskaperna hos modellerna på två sätt. Å ena sidan så används analytiska metoder som stabilitetsanalys eller symmetrimetoder för att analysera beteendet hos lösningarna samt specifika egenskaper hos modellen. Å andra sidan så används numeriska metoder för att kalibrera modellerna till experimentell data där en betoning ligger på att uppskatta kinetiska parametrar i modellen. Det övergripande syftet är att förbättra tillvägagångssätten för att validera och konstruera modeller för att i slutändan kunna fånga fundamentala fysikaliska egenskaper hos det studerade systemet med hjälp av modellen genom att kodifiera dessa matematisk i teoretiska objekt såsom symmetrier.