Systembiologi
Kort om kursen
Kursen i Systembiologi riktar sig till dig som är intresserad av en karriär inom bioinformatik eller molekylärbiologisk, biokemisk och bioteknisk forskning och utveckling med inriktning mot data-analys. Du lär dig programmering, matematisk modellering och AI/maskininlärning med biologiska nätverk. Vid kursens slut kommer du att kunna hantera komplexa biologiska frågeställningar med hjälp av moderna beräknings- och modelleringsstrategier. Dina förvärvade färdigheter är mycket eftertraktade både inom akademisk forskning och i industrin.
Om utbildningen
I kursen Systembiologi får du kunskap om hur du kan analysera och förstå komplexa biologiska system, till exempel signaleringsvägar, organeller och hela celler, med hjälp av artificiell intelligens (AI) och matematisk modellering.
Först lär du dig att hantera och bearbeta stora datamängder för exempelvis proteiner (proteomik) och ämnesomsättningsprodukter (metabolomik). Sedan fördjupar du din förmåga att använda AI i form av olika maskininlärningstekniker samt matematisk modellering för att förstå hur biomolekyler påverkar varandra och samarbetar i nätverk.
Genom projektbaserat lärande, där du arbetar med storskalig data från aktuella forskningsprojekt, får du möjlighet att tillämpa och vidareutveckla dina förvärvade kunskaper. Under projekten utvecklar du dina färdigheter i programmeringspråket Python samt i molekylärbiologisk och biokemisk statistik, och lär dig att använda moderna bioinformatiska verktyg för att presentera och tolka stora biologiska datamängder.
Kursen består av två delar:
- En teoretisk del (7,5 högskolepoäng) med föreläsningar och litteraturseminarier.
- En praktisk del (7,5 högskolepoäng) där du får erfarenhet av dataanalys. Du lär dig att utvärdera datasetens kvalitet, utforma arbetsflöden för analys och integrera flera typer av 'omics'-data för att modellera och simulera biologiska system.
Kursen är på engelska.
Behörigheter och urval
Behörighet
För tillträde till kursen krävs minst 120 hp (eller motsvarande) inom något av följande områden: medicin, farmaci, naturvetenskap (inklusive matematik).
Det krävs en grundläggande kodningsvana (rekommenderas: Python) såsom från kursen BIO511 (eller motsvarande).
Vidare rekommenderas kursen BIO512 (eller motsvarande).
Dessutom krävs engelskakunskaper till nivån Engelska 6/Engelska Kurs B från Svenska Gymnasieskolan, eller vara certifierad av ett internationellt erkänt prov, till exempel TOEFL eller IELTS eller motsvarande.
Urval
Högskolepoäng, max 165 hp
Efter studierna
Kursen i Systembiologi ingår i masterprogrammet i bioinformatik. Du kan också läsa den som en fristående kurs.
Så är det att plugga
Undervisningen
Kursen består av:
- föreläsningar
- gruppseminarier
- presentationer
- datalaborationer
- projekt
- gruppdiskussioner.
Under hela kursen får du vägledning av erfarna lärare.
Lokaler
Undervisningen sker i huvudsak i Medicinarelängan och i det nybyggda huset Natrium på Medicinareberget i Göteborg
